En una alejada zona lluviosa el equipo de Itachi y Kisame (solo Kisame) se derrotan al Yonbi (4 colas), y lo llevan ante Pain para la ceremonia de extraccion y tambien la del Sanbi (3 colas) que atraparon anteriormente Deidara y Tobi, Se conforman los equipos de busqueda de Kohona y Hebi para la caza del Akatsuki Sharingan.
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Esta es la primera parte del especial de la vida de Kakashi en el anime Naruto Shippuden, como podran ver la historia se basa en la ultima mision como grupo de Kakashi, Rin, Obito y Yondaime en la cual su objetivo es destruir el puente Kenobi, cuenta como kakashi se convierte en capitan despues de acender a Jonnin dandole celos a Obito, en lo respectivo del capitulo el grupo se divide dando la oportunidad del secuestro de Rin y ocasionalmente al desesperamiento de Obito.
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La segunda parte del especial es el mas conmoverdor de las dos partes, la unión de Kakashi y Obito para salver a Rin durante esto kakashi pierde su ojo izquierdo y esto hace despertar el Sharingan de Obito en el nivel 2, mas adelante por un ataque inesperado del enemigo Obito es aplastado por una roca gigante, Obito decide darle su Sharingan a Kakashi Para asi salvar a Rin.
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Jugo ataca con a Sasuke con trenebda furia despues de que este acertara en su predicción de quien lo liberaria, mientras tanto Suigetsu busca la salida y decide destruir las peredes hasta encontar a Karin pero se encuentra con el bipolar atacandolo con la espada de Zabusa sin acerle daño, sasuke interviene en la pelea deteniendola para convercer a Jugo de que lo ayude en su mision, ya convencido el Uchiha les cuenta alos tres que los recluto para matar a su hermano mayor Itachi Uchiha.
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Kabuto explica que él mató a Rinji, y que Orochimaru quiere al Sanbi para prepararse para la guerra próxima. Él revive el cadáver de Rinji, el cual usa para atacar a Guren y a Yukimaru. Guren logra aguantar cristalizandose ella misma con Rinji. La profunda pena de Yukimaru hace que él use su poder en el Sanbi, rompiendo el Jutsu del equipo de sellado. Naruto usa su Jutsu de clones para atacar al Sanbi, forzándolo debajo del agua y parando su rabia. Naruto va a donde se encuentra Yukimaru y le dice que ellos se irán a casa juntos. 
El Equipo de sellado sigue sellando al Sambi con la ayuda de Katsuya mientras que Kakashi, Yamato y Shino derrotan a los hombres de Rinji y se disponen a encontrar a Yukimaru. Mientras tanto, Naruto y Guren encuentran a Rinji con Yukimaru, y Rinji le revela que Guren fue la que mató a su madre. Yukimaru perdona a Guren, sin embargo Rinji trata de atacarla, pero es parado por Naruto. Entonces se revela que Rinji es Kabuto disfrazado, quien amenaza con matar a Naruto si él se mete en su camino. 
El Equipo de sellado se dispone a contener el De tres colas otra vez, y decide a Sai tomar Yuukimaru en algún sitio la caja fuerte, pero él es atacado por los hombres de Kabuto. Rinji los encuentra, pero ellos deciden no trabajar para Orochimaru más. Ellos de repente comienzan a sufrir efectos secundarios de sus poderes, y Rinji les da un antídoto después de la fabricación de ellos promete no traicionarlo. El Equipo de Sellado es atacado por los hombres de Rinji, pero es defendido por Kakashi, Yamato y Shino. Rinji hace a Yukimaru comer más píldoras para controlar al Sanbi.
Naruto y Guren se ayudan el uno al otro de los hambrientos mini Sanbi cuando el equipo de Rinji ataca al grupo de Lee. Yūkimaru y Kakashi idean un plan para rastrear al Sanbi con el poder del chico y sacar a Naruto y a Guren. Después Naruto y Guren se escapan de una ilusión que hace la niebla, Naruto comienza a comprender las buenas intenciones de Guren. Yūkimaru entonces toca la canción que su madre le enseñó directamente encima donde el Sanbi esta sumergido y Kakashi hace una grieta en la barrera de la bestia; Naruto y Guren oyen la melodía y vuelan a su salida. 
Guren trata de atacar a Naruto dentro del Sanbi, pero, en su debilitado estado, es incapaz de hacerlo y se desmaya. Mientras tanto, Kakashi le dice a Sakura y a Ino que sanen a Yūkimaru mientras el, Shizune, Kiba, Sai, y Hinata buscan a Naruto. Naruto y Guren pronto encuentran una horda de mini-sanbi que tratan de atacarlos, pero ellos los eluden y comienzan a discutir sobre Yūkimaru. Mientras Yūkimaru despierta, Naruto llama a un montón de clones de sombra para buscar una salida al estomago de la bestia. En otro lugar, Kabuto da Marcas de Maldición a los hombres de Rinji.
Yūkimaru decae y el Sanbi ataca a Guren. Yūkimaru usa su poder para contener al Sanbi, pero agota su chakra y es incapaz de hacerlo. Guren deja su posición y protege Yūkimaru con un escudo de cristal. Naruto sale a buscar a Yūkimaru, pero termina luchando contra el Sanbi con Guren. A pesar de sus esfuerzos para derrotarlo, la bestia los domina, y luego procede a tragarlos. Mientras tanto, Kakashi, Shino, y Sai encuentran a Yūkimaru inconsciente y huyen con él, dejando frustrado a Kabuto.
Hinata, Sakura y las demas, logran formar una posición del sello, mientras el mas reciente miembro de Akatsuki Tobi las espia, ahora los insectos de Shino estan listos, y ahora son invulnebrables al ataque de Guren, y mientras Lee, Ten Ten y Kiba con Akamaru logran vencer facilmente a los esclavos de Orochimaru. 
Se forman 3 equipos: el equipo que sellara al sanbi, el equipo n-1 conformado por Hinata, Sakura, Hino y Mitzuki, el equipo n-2 de proteccion:Lee, Ten Ten, y Kiba con Akamaru, y el equipo n-3 que peleara con Guren, formado por Kakashi, Naruto, Sai y Shino.
Los refuerzos de Konoha llegan al equipo de Naruto, quien traen consigo una nueva mision: Sellar al Sanbi para que no caiga en las manos equivocadas de Orochimaru y Akatsuki y llevarse a Yukimaru quien posee un poder extraño que se vincula con el poderoso tres colas.
Naruto entra en la niebla para buscar a Yuukimaru, mientras Guren sigue alerta para proteger a Yuukimaru, que se encuentra muy debil sin poder moverse. Cuando ambas partes de encuentran, Guren termina muy confundida por las palabras de Naruto 
Dentro de la extensa y Poderosa Niebla, los ninjas de Konoha gestionan una cita para encontrarse con Naruto. Los ninjas refuerzan la guardia cuando se dan cuenta de que la niebla creada por el Sanbi causa ilusiones. Naruto y sus amigos descubren que su enemigo es el poderoso Bijuu de tres colas, ante esto, Kakashi decide pedir ayuda a la Aldea de Konoha.
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El equipo de Kakashi llega para ayudar al equipo de Kurenai y recuperar a Hinata. Guren decide retirarse y va al punto de reunión con sus hombres en su base. Después de que Hinata es liberada, Kakashi dice a Sakura y Sai que permanescan con ella hasta que ella este mejor, asi los demas persiguen a sus enemigos. En la base de Guren, Kabuto llega y lleva a todos al lago de antes. Él ata con una correa a Yūkimaru a su máquina y Guren crea cinco pilares cristalinos alrededor de ellos. Cuando la máquina amplifica el chakra de Yūkimaru, la bestia de tres colas comienza a emerger. 
Guren logra encerrar al equipo de búsqueda en una bóveda de cristal. Luego con la ayuda de unas copias ataca y logra capturar a Hinata como rehén en su técnica de cristal. Mientras tanto el equipo de refuerzo llega a la bóveda creada por Guren, sin medios para atravesarla, Naruto decide utilizar su nueva técnica con Gamatatsu.
Sakura interrumpe a Naruto en su entrenamiento para que puedan partir. Mientras tanto, los subordinados de Guren atacan al equipo de búsqueda separandolos, en una clara ventaja, se retiran tras descubrir la técnica que preparaba Shino. Ya habiendo analizado las habilidades de los enemigos, Guren se prepara para atacar. 
Guren llega con sus subordinados junto con Yūkimaru y le informan de la presencia del equipo de busqueda. Ella ordena el ataque inmediato. Mientras tanto, Naruto descubre la misión que se le había ocultado y convence a Tsunade que lo deje ir, por lo cual acelera su entrenamiento con Gamakichi y Gamatatsu.
Kabuto encarga a Guren el cuidado de Yūkimaru, éste enferma en el viaje y Guren debe cuidarlo. Mientras tanto, Shino encuentra una especie de insecto que sobrevivió a los critales, y se dispone a empollar más. Tsunade ordena a Yamato unirse al equipo de búsqueda de Kakashi junto con Sai y Sakura.
Kakashi le da el golpe final a Kakuzu y todos regresan a Konoha. Shikamaru se encuentra con Kurenai en el cementerio, donde tras una conversación se da a entender que Kurenai está embarazada de Asuma. Tsunade, al ver las heridas de Naruto, le ordena a Kakashi que no permita que Naruto vuelva a utilizar su técnica, pues ésta le daña incluso a él y ni ella puede curarlo. Mientras tanto, en la guarida de Orochimaru, éste le ordena a Kabuto que llame a una misteriosa mujer llamada Guren.
